Средний мозг, mesencephalon, развивается из среднего мозгового пузыря и соответствует со стороны дорсальной поверхности участку ствола головного мозга в пределах между основанием шишковидного тела (уровень задней спайки) спереди и передним краем верхнего мозгового паруса (или местом выхода блоковых нервов) сзади; со стороны вентральной поверхности — между задней поверхностью сосцевидных тел спереди и передним краем моста сзади.


В среднем мозге различают крышу, расположенную на задней поверхности, и ножки мозга, залегающие на его передней поверхности.

Полостью среднего мозга является водопровод мозга, соединяющий полость III желудочка с полостью IV желудочка.